青科沙龙：华安生物邀请青年学者分享科学发现
青科沙龙第58期丨基于中国阿尔茨海默病人群临床队列的生物标记物研究
2023-09-18
该研究通过全国多家医院（北方的首都医科大学附属天坛医院、北京协和医院、西南方的四川大学附属华西医院、沿海地区的复旦大学附属华山医院、浙江大学附属第二医院、以及中部的中国科学技术大学附属第一医院）纳入来自全国各地的患者样本，通过多中心队列横向与纵向随访研究，探讨了在A/T/N框架下血液生物标志物在中国AD患者人群中的变化特征以及用于早期筛查AD的适应性。
青科沙龙第57期丨绘制小鼠神经系统的单细胞时空谱系图谱
2023-09-18
2023年7月17日，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）陈跃军研究组在Nature Methods上发表了题为Comprehensive spatiotemporal mapping of single-cell lineages in developing mouse brain by CRISPR-based barcoding的文章。该研究通过建立能够应用于小鼠体内任意组织器官的谱系示踪新技术——CREST，解析了小鼠中脑在胚胎发育过程中的单细胞时空谱系图谱，揭示了小鼠中脑发育过程中新的谱系分化路径和分子调控机制。CREST技术为高通量解析小鼠组织器官发育的单细胞谱系提供了全新的工具，为从谱系视角研究各种发育疾病的发病机制提供了新的研究工具。
青科沙龙第56期丨激酶RIPK1与细胞命运决定
2023-09-18
近日，美国哈佛医学院魏文毅教授，中科院生物与化学交叉研究中心主任袁钧瑛教授，索尔克生物研究所的Reuben Shaw 教授，中科院上海有机化学研究所潘李峰教授，中科院生物与化学交叉研究中心许代超教授共同通讯在Science 在线发表题为“Metabolic orchestration of cell death by AMPK-mediated phosphorylation of RIPK1”的研究论文，该研究表明代谢应激促进了TRAIL受体介导的受体相互作用蛋白激酶1 (RIPK1)的激活，而AMPK通过在Ser415位点磷酸化抑制RIPK1以抑制能量应激诱导的细胞死亡。
青科沙龙第55期丨ZmRPN1特异调控玉米花粉数量自然变异的机理解析
2023-09-18
近日，中国农业大学农学院国家玉米改良中心贺岩教授团队在Plant Biotechnology Journal杂志在线发表了题为 “ZmRPN1 confers quantitative variation in pollen number and boosts hybrid seed production in maize” 的研究论文。该论文通过不同环境下全基因组关联分析，揭示了一个特异调控花粉数量基因ZmRPN1，研究发现ZmRPN1启动子区的序列变异可能在其对玉米花粉数量调控中起重要作用。
青科沙龙第54期 | Cell：精子运动的结构基础
2023-09-18
2023年6月8日，西湖大学生命科学学院、西湖实验室吴建平团队与浙江大学桂淼团队和南京医科大学刘明兮团队合作，在 Cell 期刊发表了题为：Structures of sperm flagellar doublet microtubules expand the genetic spectrum of male infertility 的研究论文。
青科沙龙第53期丨叶绿体蛋白转运体TOC-TIC超级复合物的结构解析
2023-09-18
2022年11月21日，西湖大学闫浈课题组在际顶尖学术期刊 Cell 在线发表题为《Structure of a TOC-TIC supercomplex spanning two chloroplast envelope membranes》的研究论文，揭开了叶绿体蛋白转运体之谜，尝试利用生物化学和结构生物学的方法来揭示TOC-TIC复合物的组成、组装和转运机制。
青科沙龙第52期丨脑脊髓海绵状血管畸形致病机制及动物模型研究
2023-09-18
北京脑科学与类脑研究中心的戈鹉平实验室和首都医科大学宣武医院神经外科洪韬、张鸿祺团队合作，在Brain杂志上发表了题为“Somatic variants of MAP3K3 are sufficient to cause cerebral and spinal cord cavernous malformations”（MAP3K3单基因体细胞突变足以诱发脑与脊髓海绵状血管畸形）的研究论文。
青科沙龙第51期丨可解释的人工智能应用于系统生物学和医学信息学
2023-09-18
2023年5月9日，哥本哈根大学、哈佛大学医学院的科学家在 Nature Medicine 期刊发表了题为：A deep learning algorithm to predict risk of pancreatic cancer from disease trajectories 的研究论文。研究团队训练出了一种名为CancerRiskNet的深度学习算法，只需要向AI提供患者电子病历数据，就能推算出患者患上胰腺癌的风险。这一算法能在胰腺癌发生前3年推测出患病风险，可谓是AI的“精准算命”。
青科沙龙第50期丨人体肌肉骨骼系统基因表达数据库的构建和应用
2023-09-18
该研究利用生物信息学计算工具和云数据库平台，构建了首个大规模、标准化、可交互的人体肌肉骨骼系统基因表达数据库MSdb，并利用数据库收集的单细胞数据，开发了基于变分自编码器（Variational autoencoder，VAE）深度学习架构的单细胞数据整合分析算法scVAE，为肌肉骨骼系统高通量测序数据的深入挖掘和高效利用提供了有力的工具。
青科沙龙第49期丨抗体基因超突变的DNA柔性基础
2023-09-18
2023年4月24日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心孟飞龙团队和上海交大医学院上海市免疫学研究所叶菱秀团队（博士生王燕燕为论文第一作者）在国际顶尖学术期刊 Cell 发表了题为：Mesoscale DNA Feature in Antibody-Coding Sequence Facilitates Somatic Hypermutation 的研究长文。该研究系统揭示了抗体基因互补决定区（CDR）偏好性突变背后的生化机制，特别是抗体基因编码序列DNA柔韧性的重要生理作用。这项研究解决了困扰免疫学家40多年的科学难题，为优化现有动物模型及推动下一代抗体基因人源化动物模型的发展提供了全新的见解。
青科沙龙第48期丨小鼠胚胎干细胞中METTL14非依赖于m6A的调控转录功能
2023-09-18
2023年2月23日，北京大学刘君研究员团队和美国芝加哥大学何川教授组在Protein & Cell在线发表了题为METTL14 is a chromatin regulator independent of its RNA N6-methyladenosine methyltransferase activity的研究论文。这项工作揭示了METTL14非依赖于METTL3和m6A的对于异染色质和RNA转录的新型调控机制，以及这种调控功能在小鼠胚胎干细胞干性维持和分化中的重要作用。
青科沙龙第47期丨Nature一作解读：一个新的无机磷存储细胞器调控肠道发育及稳态
2023-09-18
2023年5月4日，哈佛大学Norbert Perrimon研究团队在Nature杂志发表了题为 “A phosphate-sensing organelle regulates phosphate and tissue homeostasis” 的研究论文。该研究首次鉴定了昆虫肠道细胞中存储磷的细胞器，并发现了无机磷酸盐参与肠道稳态调控的机制。